Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 MED29-201ENST00000315588 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 HECW1-IT1-201ENST00000322220 1839 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 IFT22-211ENST00000621899 2272 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC005865.1-201ENST00000432994 3004 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 EPS8L3-203ENST00000369805 2325 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 DERL1-201ENST00000259512 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SLC12A8-202ENST00000430155 2831 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 GPR156-202ENST00000461057 2525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 HKR1-204ENST00000544914 2854 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 LINC01588-203ENST00000529902 4279 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SNX12-207ENST00000622277 2422 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CWC22-202ENST00000410053 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ATP6V0A4-203ENST00000393054 3090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MFAP4-201ENST00000299610 1873 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MFAP4-203ENST00000497081 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TIPARP-202ENST00000461166 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 GPATCH2L-209ENST00000556663 2112 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 RNF4-222ENST00000541204 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ABCF2-201ENST00000222388 2185 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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