Protein–RNA interactions for Protein: P60022

DEFB1, Beta-defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB1P60022 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DEFB1P60022 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms