Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms