Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA2P51531 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms