Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC245884.8-201ENST00000599382 880 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 AC080038.2-201ENST00000617734 423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 LINC01988-202ENST00000636975 921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NESP48681 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 OR4C6-201ENST00000314259 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 OR2T34-201ENST00000328782 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 OR2T3-201ENST00000359594 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 AC145285.1-201ENST00000469929 694 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 PUDPP2-202ENST00000628080 737 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 RTP2-201ENST00000358241 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NESP48681 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NESP48681 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NESP48681 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NESP48681 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NESP48681 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NESP48681 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NESP48681 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NESP48681 AC006967.2-201ENST00000426169 432 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NESP48681 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NESP48681 AD000091.1-201ENST00000592379 287 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NESP48681 AC138907.9-201ENST00000623747 986 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NESP48681 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 AC006001.3-205ENST00000428370 579 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 AC023157.1-201ENST00000453713 402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 RN7SL105P-201ENST00000475661 299 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 SLC25A5P6-201ENST00000515328 886 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 AC022217.2-201ENST00000518941 472 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 MUTYH-236ENST00000529984 1029 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 AC005154.1-227ENST00000579174 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NESP48681 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 SPACA7-201ENST00000283550 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 LDHAL6FP-201ENST00000405916 1082 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 CNTFR-AS1-203ENST00000453642 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 SPTY2D1-AS1-202ENST00000511927 573 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 AC011389.2-201ENST00000514811 365 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms