Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFSF9P41273 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms