Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PPARGP37231 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PPARGP37231 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PPARGP37231 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PPARGP37231 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PPARGP37231 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PPARGP37231 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PPARGP37231 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PPARGP37231 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PPARGP37231 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms