Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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HOXA13P31271 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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