Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 PSMC1P1-201ENST00000478110 1320 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXB1P14653 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXB1P14653 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXB1P14653 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXB1P14653 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXB1P14653 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HOXB1P14653 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 ZCCHC9-202ENST00000380199 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms