Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC192P0DO97 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms