Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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