Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYRIPQ8NFW9 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms