Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CABP7Q86V35 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms