Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRAPPC6BQ86SZ2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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