Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 TP53-203ENST00000413465 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 TTC21B-AS1-202ENST00000443032 544 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 ETFRF1-210ENST00000556927 833 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AC015936.1-201ENST00000591013 1028 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 CTXN3-204ENST00000620385 1208 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 SPATA22-201ENST00000268981 1280 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 CPO-201ENST00000272852 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01559Q495D7 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms