Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKOR2Q2VWA4 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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