Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms