Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms