Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRB1P82279 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRB1P82279 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRB1P82279 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRB1P82279 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRB1P82279 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRB1P82279 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRB1P82279 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRB1P82279 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRB1P82279 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRB1P82279 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRB1P82279 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRB1P82279 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRB1P82279 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms