Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IRX3P78415 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRX3P78415 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms