Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms