Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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HOXD10P28358 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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HOXD10P28358 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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HOXD10P28358 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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HOXD10P28358 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD10P28358 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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