Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
YY1P25490 RTN3-204ENST00000354497 1407 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 LINC00424-201ENST00000413124 654 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 ENTPD1-AS1-210ENST00000452942 864 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 AC106782.3-201ENST00000563429 258 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 OPN1MW-201ENST00000595290 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 AZU1P1-201ENST00000603479 385 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 AC024580.2-201ENST00000623363 231 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 SPATA22-203ENST00000397168 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
YY1P25490 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
YY1P25490 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
YY1P25490 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
YY1P25490 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
YY1P25490 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
YY1P25490 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
YY1P25490 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 OOEP-201ENST00000370359 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 AL008719.1-201ENST00000430449 473 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 AL354707.1-204ENST00000451142 846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 CMTM1-206ENST00000457188 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YY1P25490 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms