Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AP002852.2-201ENST00000519630 740 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HOXB1P14653 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HOXB1P14653 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HOXB1P14653 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HOXB1P14653 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HOXB1P14653 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HOXB1P14653 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HOXB1P14653 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC092953.1-201ENST00000460975 543 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC125618.1-201ENST00000472596 563 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AL627171.2-201ENST00000635177 1090 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXB1P14653 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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