Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT13P13646 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRT13P13646 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT13P13646 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRT13P13646 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms