Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms