Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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BCKDHAP12694 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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BCKDHAP12694 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BCKDHAP12694 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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