Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ITGB3P05106 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGB3P05106 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB3P05106 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB3P05106 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB3P05106 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB3P05106 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB3P05106 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB3P05106 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB3P05106 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB3P05106 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB3P05106 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB3P05106 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB3P05106 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB3P05106 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB3P05106 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGB3P05106 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms