Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SCN2BO60939 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SCN2BO60939 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SCN2BO60939 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SCN2BO60939 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SCN2BO60939 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SCN2BO60939 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SCN2BO60939 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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