Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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HOXA3O43365 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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HOXA3O43365 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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HOXA3O43365 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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HOXA3O43365 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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HOXA3O43365 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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HOXA3O43365 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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HOXA3O43365 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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