Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms