Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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