Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

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Length 1,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP2Q9UDT6 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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