Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM5Q9C035 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms