Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN18Q99952 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms