Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LMO3Q8TAP4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LMO3Q8TAP4 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LMO3Q8TAP4 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LMO3Q8TAP4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LMO3Q8TAP4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LMO3Q8TAP4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LMO3Q8TAP4 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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