Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CABP7Q86V35 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CABP7Q86V35 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CABP7Q86V35 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CABP7Q86V35 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CABP7Q86V35 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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