Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms