Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms