Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM71Q2Q1W2 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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