Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms