Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SIX1Q15475 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SIX1Q15475 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SIX1Q15475 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SIX1Q15475 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SIX1Q15475 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SIX1Q15475 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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