Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ZNF226-204ENST00000454662 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AL354919.1-201ENST00000453837 2257 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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FOXD4Q12950 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXD4Q12950 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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