Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.6 ms