Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 AC013269.2-201ENST00000422631 727 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 AL606834.1-201ENST00000553836 1169 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 C3orf36-201ENST00000408895 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NESP48681 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 RPSAP5-201ENST00000485258 884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 AC011456.1-201ENST00000592270 536 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NESP48681 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NESP48681 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NESP48681 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NESP48681 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NESP48681 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 CNN2P1-201ENST00000453616 918 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 AC097658.2-201ENST00000512715 624 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 TMEM253-206ENST00000556585 1236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 AC002347.2-201ENST00000584139 171 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 AC005336.1-201ENST00000585431 1243 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 FXYD3-210ENST00000604621 548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NESP48681 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 BARD1-214ENST00000620057 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 CD300LB-201ENST00000314401 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 AC244197.2-201ENST00000370438 655 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 NDFIP2-AS1-201ENST00000457171 431 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 NREP-218ENST00000509427 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 ALG1L14P-201ENST00000514230 434 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 AC051619.6-201ENST00000558039 595 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 RN7SL750P-201ENST00000582814 238 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 AC092069.1-201ENST00000589120 270 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NESP48681 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms