Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP8P40818 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP8P40818 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP8P40818 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms