Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H1P32780 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms