Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM228BP0C875 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM228BP0C875 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM228BP0C875 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM228BP0C875 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM228BP0C875 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM228BP0C875 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM228BP0C875 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM228BP0C875 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM228BP0C875 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM228BP0C875 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM228BP0C875 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM228BP0C875 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM228BP0C875 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM228BP0C875 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms