Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VTNP04004 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VTNP04004 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VTNP04004 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms