Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms